GENÓMICA COMPUTACIONAL DE PLANTAS Y ORGANISMOS ASOCIADOS

Profesores: Jaime Iranzo, Alejandro Couce y Joaquín Giner

En los últimos años debido a la gran cantidad de datos genómicos que se están generando por “Next Generation Sequencing”, existe una fuerte demanda laboral de bioinformáticos especializados en el análisis de este tipo de datos. El objetivo principal de la asignatura es que el alumno obtenga un visión global de las últimas técnicas de secuenciación de ADN y ARN aplicadas al estudio de Plantas y su interacción con microorganismos. Los alumnos aprenderán las últimas técnicas que se aplican en la investigación genómica de plantas como son la secuenciación de ADN, análisis transcriptómicos mediante RNA-seq o el estudio de las comunidades de microbios que interaccionan con plantas mediante el uso de técnicas de metagenómica. Los estudios basados en estas técnicas están revolucionando diferentes campos como son la agricultura o la protección de especies protegidas. Los alumnos aprenderán a trabajar con estos datos, a procesarlos y analizarlos usando herramientas de programación basadas en BASH y R.